由运输业者仲介结算业务，通常需要额外支付手续费。因为运送方必须处理货物与现款，会有遭遇强盗的忧虑。

支付货款时送货员可能没有零钱可以找钱，尤其是有多件代收货物时。可能为了找钱再次造访收件人，甚至是拒绝交货。最好事先准备好零钱。

对个人事业主或企业而言，必须和快递企业签约合作，并且每周或每月才结一次款项，造成资金周转与成本增加的压力[1]。

此外，可能收件人未确认内容物或无法当面确认内容物（通常收件时只能确认外包装完整未损坏，运输业者不对内容物负责）就直接付款，事后发现和订购商品有出入而产生纠纷。基于法规这类情况可能无法求偿[2]，亦有利用这点的诈骗手法存在。例如日本的货到付款诈骗（代金引换邮便诈欺（日语：代金引換郵便詐欺））。因此有些业者在送货收款后不会立刻将款项交给卖方，而会有段缓冲期以避免这类情形发生。

当买卖物品需使用超商货到付款时，卖家寄出的货物若是逾期未领，货物将会被退回并由卖家承担运费进而导致部分卖家不愿意使用超商货到付款。